牡丹常见的病害是褐斑病，初起时叶面出现黄绿色斑点，以后逐渐扩大，形成褐色或黑色斑纹。可用波尔多液每月喷1-2次，若病情严重则可喷3次。对染病较重的叶子要剪下烧掉，以防蔓处延。
还有一种根腐病，它专门危害牡丹根部，病状是根部变黑、腐烂，妨碍生长，重的可导致整枝死亡。防止此病在分株栽植时就要认真检查，若发现有病根，一定要剪除烧掉，并于栽植时在栽植穴中撒些硫磺粉。
常见的虫害为吹绵介壳虫。可用40%的氧化乐果乳剂加1500倍水溶液喷洒，入冬或早春时用石硫合剂涂在枝干下部，也有较好的效果。
