根腐病属于真菌病害，低温高湿和光照不足，是引发此病的主要环境条件。另外土壤粘性大、易板结、通气不良致使根系生长发育受阻，也易诱发根腐病。另外，根部受到地下害虫、线虫的危害后，伤口多，有利病菌的侵入。根腐病，用络氨铜，氯溴异氰尿酸，甲霜恶霉灵，咯菌腈或者枯草芽孢杆菌加生根剂灌根防治。
可在发病初期每亩用灭菌成(50%氯溴异氰尿酸可湿性粉剂)30克、氨基酸类液肥如(金太龙或蒜田保护剂)200克加水30公斤喷雾或灌根，隔5天防治1次，连防2～3次。发病严重的植株和死亡植株应及时拔除带出田外，防止病害传染蔓延。并在浇水时每亩用30%噻虫胺400克灌根。
可以用多菌灵，双效灵灌根。
