小麦赤霉病在小麦齐穗期时应喷施杀菌剂进行预防。在出现病情后，可以使用三唑酮、福美双等药剂进行喷雾防治，并同时加强田间管理，提高植株抗病力。
扬花前期采用一喷三防技术进行防治。
小麦抽穗扬花期遇连阴雨天时喷药防治。
每亩可用12.5%烯唑醇25-30克或25%戊唑醇15-20克或用50%多菌灵胶悬剂100-150毫升，喷药时要重点对准小麦穗部和上部叶片均匀喷雾，同时每亩加入25%吡虫啉15克和功夫菊酯100毫升，可兼治小麦蚜虫。
在清沟排水基础上，小麦始花期做好药剂防治小麦赤霉病，可用甲基硫菌灵或多菌灵加咪鲜胺喷雾防治。
