辣椒高脚苗主要是由于棚内气温较高，光照弱，昼夜温差小，湿度大，氮肥过多引起。可拉大昼夜温差，注意控水控肥，增加光照强度和光照时间，叶面喷施磷酸二氢钾或者调环酸钙控旺。
另外，棚内密度大、温度高、湿度大时，辣椒容易徒长，建议加强通风排湿，降低温度特别是夜温，喷施磷酸二氢钾或高磷叶面肥，也可以用叶绿素P2-37或助壮素控旺。注意栽培密度，同时辣椒萌芽后应避免湿度过大和夜温偏高等造成的幼苗徒长现象。
