发病初期喷洒20%甲基立枯磷乳油1200倍液或72%杜邦克露可湿性粉剂1000倍液、72.2%普力克（霜霉威）水剂400倍液，每m^2喷淋对好的药液2～3L，或95%恶霉灵（土菌消）精品4000倍液，每m^2喷淋3L。
到目前为止还没有防治豌豆根腐病的有效药物，由于豌豆根腐病属土传疾病，防治豌豆根腐病可通过豌豆与非豆科作物进行4-5年的轮作倒茬，建立科学合理的耕作制度来预防。
豌豆根腐病的药物防治方法有可以用甲基立枯磷乳油1200倍液喷淋。
