小麦灰霉菌属弱寄生菌，在田间靠气流传播，遇有潮湿环境或连续阴雨，病情扩展迅速，植株上下部叶片不同部位均可同时发病，形成发病中心。尤其是穗期多雨穗部易感病。感病品种叶鞘和茎秆上均可见到一层灰白霉。生产上积温低、日照少，3月份气温低且多雨发病重。品种间抗病差异明显。
小麦灰霉病是发生在小麦穗部的重要病害，该病从苗期到成熟期均可发病。
病菌以菌丝体或子囊壳在麦桩、麦秆、玉米穗、甘薯等作物残体上越冬越夏，春季气温适宜时产生子囊壳(穗腐初侵染的主要来源)，子囊壳成熟后，不断向空中释放子囊孢子，随风雨传播到扬花的麦穗上引起发病。
