生前用饱和盐水漂浮法或粪便涂片查到球虫卵囊，或死后取肠粘膜触片或刮取肠粘膜涂片查到裂殖体、裂殖子或配子体，均可确诊为球虫感染，但由于鸡的带虫现象极为普遍，因此，是不是由球虫引起的发病和死亡，应根据临诊症状、流行病学资料、病理剖检情况和病原检查结果进行综合判断。
球虫病多发生于温暖而多雨的季节,3个月龄以内的鸡，特别是3周至1。5月龄的鸡最易发病。每种艾美耳球虫几乎都有自己的侵害部位,除少数艾美耳球虫外，大多数都寄生于肠绒毛的上皮细胞内，典型的损害，通常是肠道病原学诊断的一个具有价值的指标。
鸡球虫病对雏鸡和育成鸡的危害十分严重，15～50日龄的雏鸡发生率高，死亡率可达80%以上。耐过的雏鸡生长缓慢，发育不良。成鸡多为带虫者，增重和产蛋受到一定影响。
