番茄无土栽培管理后期和在土壤的栽培管理方法基本一样，都是要番茄生长过程中保证充足的阳光和把握好最适宜番茄生长的温度。只有在施肥的时候会略有不同，因为没有土壤自然的稀释和自己吸收供给给番茄的根部，菜农需要人工直接将肥料施在番茄的根系上，浇水稀释直接让番茄吸收。
要无土栽培番茄，首先应调配栽培基质，进行消毒灭菌后即填入栽培槽，再进行播种育苗，达到标准后再进行定植，在定植后保持充足的光照和适宜温度，同时在结果后追肥一次。
