辣椒根腐病防治措施有水旱轮着，药物喷施等。
土壤改良，合理肥水，护根栽培。
选用优良品种、轮作换茬、合理肥水、加强管理。
(1)精选品种。选好并整好育苗地块。选择优质品种，并对种子进行浸种+种衣剂处理，并适期播种。(2)实行与豆科、禾本科作物进行3～5年轮作。(3)田间管理。①精耕细整土地，悉心培育壮苗，在移植时尽量不伤根，精心整理，保证不积水沤根，施足基肥。②定植后要根据气温变化，适时适量浇水。
