病鸡先流出浆液性或粘性鼻液，打喷涕，炎症继续发展时出现咳嗽和呼吸困难，可听到呼吸罗音，到后期鼻腔和眶下窦蓄积多量渗出物，并出现眼脸肿胀，眼部突出。
鸭支原体病的病理变化表现为：病鸭喉头、气管处有粘液、气管出血、鼻窦肿胀、充血。气囊浑浊，明显增厚，囊腔内有淡黄色渗出物，有的病鸭在气囊上有斑状浑浊物，肺脏淤血。
剖检时可见鼻腔、气管、支气管和气囊中含有粘液性渗出物，特征性病变是全身气囊特别是胸部气囊有不同程度混浊、增厚、水肿，随着病程发展气囊上有大量大小不等干酪样增生性结节，外观呈念珠状，少数大至鸡蛋，有的出现肺部病变。
