南瓜病虫害主要有白粉病、菜青虫、蚜虫等。防治要点①因地制宜选用耐病品种。目前种植较多的日本夷香南瓜、锦栗南瓜、桔红南瓜有一定的抗病性，但要做好提纯复壮工作，选用无病种苗。②种子消毒：播前先在阳光下晒种1-2天，以杀灭表皮杂菌，提高发芽势;用50℃-55℃温水搅拌浸种30分钟，温度降低到30℃继续浸种8-10小时，再放入1%高锰酸钾溶液消毒20-30分钟，冲净后在28℃-30℃下催芽48-72小时，露白时播种。③加强管理：合理密植，开沟排水，及时摘除病叶、老叶，加强通风透光，以增强植株长势，增施磷钾肥，提高抗病力。
细菌性缘枯病、白粉病、疫病、炭疽病、霜霉病、病毒病、斑点病等病害，还有蚜虫、黄虫、瓜蝇、夜蛾等害虫。
