喷异菌脲、腐霉利、菌核净等药剂防治。
一是与禾本科作物实行3～5年轮作；土壤消毒；可用菌核净、乙烯菌核利、多菌灵和甲基硫菌灵等防治。
辣椒菌核病可以用多菌灵或甲基硫菌灵等药剂防治。
辣椒菌核病用菌核净、甲基托布津防治较好。
选用抗病品种，加强物理化学防治。
