1、西瓜种子用50%多菌灵600倍液或70%甲基托布津1000倍液浸种4～6小时，隔2小时翻动1次，浸后将种子置于25～30℃的条件下催芽。或用55～60℃温水浸种20分钟，然后放入冷水中冷却，捞出晾干备播。2、在西瓜病毒病发病初期用20%病毒星可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳油1000倍液，或抗毒剂1号300倍液，交替用药，每7～10天防治1次，连防2～3次。及时防治蚜虫。
发病初期，用20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳剂1000倍液，或20%盐酸吗啉胍可湿性粉剂500～600倍液，或5%菌毒清水剂500～600倍液防治，每7～10天喷1次，连喷3～4次。
