南方地区多以分生孢子在葱类作物上辗转危害。北方寒冷地区以菌丝体在寄主体内或病残体上越冬后，产生分生孢子，借气流、雨水传播，经气孔、伤口侵入。发病条件为温暖多湿，低于12℃则不发病。葱蓟马刺吸的伤口是病菌侵入的门户，故此，蓟马严重发生的地段，此病也较重。
洋葱紫斑病病菌借气流、雨水传播，经气孔、伤口侵入。发病条件为温暖多湿，低于12℃则不发病。蓟马刺吸的伤口病菌易侵入，蓟马严重发生的地段，此病也较重。
洋葱紫斑病在北方寒冷地区以菌丝体在寄主体内或随病残体在土壤中越冬，翌年产出分生孢子，借气流或雨水传播，经气孔、伤口或直接穿透表皮侵入，发病适温25—27C，低于12℃则不发病，病菌产孢需湿度高，萌发和侵入需有水滴存在，因此温暖多湿的夏季发病重。此外，沙质土、旱地、老苗、缺肥或蓟马为害重的地块发病重。
