刮除病斑后表面要涂波美10度石硫合剂，或果康宝50-100倍液，或菌立灭2号50-100倍液，或5%田安水剂5倍液。为防止复发，一要连续涂药，一般保护性药剂应每月涂1次，连续4-5次；二要尽量采用渗透性较强的药剂或内吸性药剂，如菌立灭、果康宝等。
加强肥水管理，减少虫伤、冻伤、日灼等伤害。生长季节随时剪除病枯枝；将病枝、病树及刮除的病皮清出果园及时烧掉。
苹果树腐烂病冬春季刮病斑，涂治疗药。
菜果树腐烂病应在春秋两季刮树斑用药物治方。
