甜椒根腐病的发病原因的水分过多。
早春和初夏阴雨连绵，昼暖夜凉的天气有利发病，植地低洼积水，田问郁闭高湿.茎节受蛞蝓为害伤口多或施用未充分腐熟的土杂肥，会加重发病。
高湿条件下极易发生，早春和初夏阴雨连绵、高温高湿、昼暖夜凉的气候有利于发病，春季、梅雨季多雨发病严重；种植地低洼积水、田间郁闭高湿、植株茎节受蝼蛄危害伤口多、施用未充分腐熟土杂肥，会加重病情；连作地、低洼地、黏土地、植株根部受伤的田块发病重。
甜椒根腐病的发病条件是：高温多湿。
甜椒根腐病病原包括非侵染性即生理性沤根和侵染性即传染性病害两个方面。生理性沤根主要由于起畦过低和水分管理不当所造成。起畦不够高，又采用沟灌，每次沟灌时灌水过深，灌水时间过长，甜椒根系处于水浸状态，造成土壤氧气不足，根系正常呼吸受阻，活力降低，终导致根系吸收、输导功能被破坏，植株萎蔫死亡。沤根不具有传染性，患部无任何病征可寻即使通过保湿和组织分离培养也找不到病原物。传染性根腐病由半知菌亚门的腐皮镰刀菌侵染所引起。通常在病部表面或通过保湿可见霉状物病征。通过组织分离培养可获得致病菌，人工接种可引起发病。
辣椒根腐病在辣椒定植后始发，高湿条件下极易发生，早春和初夏阴雨连绵、高温高湿、昼暖夜凉的气候有利于发病，春季、梅雨季多雨发病严重；种植地低洼积水、田间郁闭高湿、植株茎节受蝼蛄危害伤口多、施用未充分腐熟土杂肥，会加重病情；连作地、低洼地、黏土地、植株根部受伤的田块发病重。
