苗床稻种盖土厚，使种子在低温环境中时间过长，发芽缓慢或者停止发芽，在微生物作用下，开始发酵变质，导致烂种，而且产生酸性物质，影响周围的种子发芽和生长，造成出苗少，损失稻种，影响种子的发芽率。
覆土厚造成苗床气温低，通透性差，出苗慢。
苗床覆盖泥土过厚，使发芽后的幼苗根系感受温度不够，影响幼芽秧苗的正常生长，使苗床期生长和分蘖缓慢，造成幼苗分蘖不正常，影响插秧后，大田植株参差不齐，被分蘖正常，长势良好的植株遮挡阳光，争吸营养，生长和分蘖更加缓慢，造成弱苗。
