青花菜病害以病毒病、黑腐病、霜霉病较为常见，虫以菜青虫小菜蛾、甘蓝夜蛾、蚜虫较多，要及时防治，对症下药，减少损失。
病毒病可用病毒A、植病灵防治；黑腐病可用农用链霉素、可杀得等防治；霜霉病可用甲霜灵锰锌、杀毒矾、克露等防治。主要虫害有菜青虫、小菜蛾、甘蓝夜蛾、蚜虫等，可用阿维菌素、功夫、吡虫啉、除尽等防治，此外，使用频振灯诱杀成虫效果较好，可以大大减少农药的使用，减少蔬菜产品中农药的残留，还可降低成本。
