采取化学防治措施，坚持预防为主原则。田间一旦发现辣椒炭疽病病果、病株，及时从田间清除销毁并喷药防治。药剂可选用农割15毫升（或阿米妙收10毫升）+爱苗10毫升兑水30斤全株叶面喷雾，建议每亩喷液量60斤，使辣椒喷匀喷透。由于湿度因素是辣椒炭疽病发生的重要原因，下雨天气应加强药剂防治。
在化学防治上，定植前要搞好土壤消毒，结合翻耕，每亩喷洒3000倍96%天达恶霉灵药液50千克，或撒施70%敌克松可湿性粉剂2.5千克，或70%的甲霜灵锰锌2.5千克，杀灭土壤中残留病菌。定植后，每10～15天喷洒一次1∶1∶200倍等量式波尔多液，进行保护，防止发病（注意！不要喷洒开放的花蕾和生长点）。每2次波尔多液之间，喷1次600～1000倍瓜茄果专业型天达—2116（或5000倍康凯、或5000倍芸薹素内酯），与波尔多液交替喷洒。
