（1）有机肥料含有大量的有机质，具有明显的改土培肥作用；化学肥料只能提供作物无机养分，长期施用会对土壤造成不良影响，使土壤“越种越馋”。（2）有机肥料含有多种养分，所含养分全面平衡；而化肥所含养分种类单一，长期施用容易造成土壤和食品中的养分不平衡。（3）有机肥料养分含量低，需要大量施用，而化学肥料养分含量高，施用量少。（4）有机肥料肥效时间长；化学肥料肥效期短而猛，容易造成养分流失，污染环境。
有机肥料含有多种养分，但含量低，富含有机质，肥效慢，化学肥料某种养分含量高，迅效。
