玉米黑穗病是土传病害，进行土壤消毒，注意水肥管理，发病初期及时喷施杀菌剂。
一是选择抗病品种，二是药剂拌种。
1．积极选育和推广抗病品种。不同的玉米品种对黑穗病的抗性有明显的差异，选育和推广抗病品种是控制黑穗病最根本、最有效的措施。2．普遍实行轮作倒茬。实行3年以上的轮作是减轻玉米黑穗病的有效途径。3．规范购种渠道。要从有种子经营许可证的单位购买种子，推广使用包衣种子或进行药剂拌种。4.结合田间管理及早铲除或拔除病株。
