石榴干腐病主要危害果实，也侵染花蕾、花朵、果台、新梢。
在蕾期、花期发病，花冠变褐，花萼产生黑褐色椭圆形凹陷小斑。幼果发病首先在表面发生豆粒状大小不规则浅褐色病斑，逐渐扩为中间深褐，边缘浅褐的凹陷病斑，再深入果内，直至整个果实变褐腐烂，在花期和幼果期严重受害后造成早期落花落果；果实膨大期至初熟期，则不再落果，而干缩成僵果悬挂在枝梢。
石榴干腐病为害果树的枝干，同时也侵染花器、果实、果枝和新梢。在枝干发病的初期，皮层呈黄褐色，逐渐变为深褐色。之后被害部位的表皮会失水干裂，粗糙不平。病灶部位发展迅速，深达木质部位，病皮开裂，最终会使得全枝或树体逐渐干枯死亡。
石榴干腐病的危害主要是果实内部出现病变。
危害症状。在蕾期、花期发病，花冠变褐，花萼产生黑褐色椭圆形凹陷小斑。幼果发病首先在表面发生豆粒状大小不规则浅褐色病斑，逐渐扩为中间深褐，边缘浅褐的凹陷病斑，再深入果内，直至整个果实变褐腐烂，在花期和幼果期严重受害后造成早期落花落果；果实膨大期至初熟期，则不再落果，而干缩成僵果悬挂在枝梢。
石榴干腐病为害症状：1、花。在蕾期、花期发病，花冠变褐，花萼产生黑褐色椭圆形凹陷小斑，严重时可造成落花。2、果实。幼果感病一般在萼筒周围发生豆粒大小的浅褐色病斑，逐渐扩展为中间深褐色、边缘浅褐色的凹陷斑，直到整个果实腐烂，可造成早期落果。果实膨大期至初熟期受害，干缩成褐色僵果（上有许多黑色小颗粒）挂在树上，不再脱落。贮藏期可造成果实腐烂，果面上产生密集小黑点。3、枝干。新梢、果台受害变为褐色，产生分生孢子器。枝干被害，树皮初期现出黄褐色湿润状病斑，后期病部枝皮失水干缩下陷，其上发生密集小黑点，病健部分离，病皮翘起，以致剥离，病枝衰弱，叶变黄，树皮烂透后上部很快枯死，严重时可造成树体死亡。
