合理施肥可以使作物得到充足的营养，生长健壮，最终能够获得高产，同时也能提高作物的品质。但过多的使用氮肥也会使作物的抗逆性降低，病虫害严重，造成作物减产。大量施用氮肥常使细胞增长过大，细胞壁变薄，汁液多，植株柔软，易受病虫侵袭。过量施用氮肥能诱发真菌病害，例如，水稻褐斑病、小麦赤霉病等。这些病害在磷、钾用量低时更为严重。与氮相反，增施钾肥能提高作物的抗病性，特别是对真菌和细菌病害的抗性。这是因为钾既能使细胞壁增厚，阻止或减少病原菌的入侵，又能促进作物体内游离的氨基酸、单糖等低分子化合物转变为蛋白质、纤维素和淀粉等高分子物质。由于可溶性养分减少，可抑制病菌滋生。许多资料表明，充足的钾营养可降低水稻稻瘟病、赤枯病、纹枯病，玉米黑粉病，麦类赤霉病、白粉病和烟草花叶病的发病率和危害。
综上所述，施肥与作物病害的发生有着密切的关系，但对于蔬菜和果树来说，养分缺乏特别是养分不平衡同样也会降低其抗病性，加重病害发生程度，从而导致减产。
