俗语说“苗好五成收”，育成健壮无病虫害的苗子是栽培成功的一半。西红柿在两叶一心至5片叶时是1-3穗果的花芽分化期，苗期决定一茬大棚西红柿的产量和质量。
1、选择保温性能好的小温室，保证夜温不低于15度，播种前15-20天盖好棚膜烤棚。播种前5-7天装好营养钵。营养土的土、肥比为3：1，肥料要选用腐熟的有机肥，最好是生物有机肥或2个亿活菌的菌肥。
2、关键措施。⑴营养土的消毒。按床土的0.01%加入菌毒净和菌虫速灭，即1000公斤床土加入100克菌毒净和100克菌虫速灭混拌均匀进行营养土消毒。⑵装钵。装钵时要注意上松下实，并在上面留2厘米的空间，以便以后浇水。选营养钵时，不要选有毒的再生膜制的营养钵。
3、催芽播种。大棚西红柿一般在7月下旬到9月上旬播种。关键措施是：⑴浸种催芽。用55℃的温水浸种，随倒水随搅拌，并保持水温55℃5-10分钟，10分钟后缓慢加凉水待水温冷却至35℃时停止搅拌，保持30℃左右水温浸种2个小时以上，最长不超过6个小时。将种子搓洗干净置于25-30℃的温度条件下催芽，经过24小时有一半种子露白时就可进行播种。⑵播种。将2-3粒发芽的种子播到营养钵的中央，而后覆土1.5厘米厚。播种完毕后，将钵面喷一遍500倍菌毒净进行杀菌。
4、出苗前的管理。重点是提高温室温度，促其尽快出苗。适当晚揭早盖。
5、出苗后的管理。当幼苗有80%出土后，应立即将畦面上的薄膜揭掉。出真叶前应适当降低温度5-7天，此时白天保持20-25℃，夜间12-15℃，且苗床不要过湿，防止发生猝倒病。第二片真叶出现后，每钵保留一株壮苗，将余苗剪掉，此时要适当提高温度，促进幼苗生长，白天22-28℃，夜间14-18℃，并给予充足的光照。从出现第一片真叶到四叶一心，要隔7-10天喷一次菌毒净800倍液、生物肥精800-1000倍液，以防猝倒病、立枯病等。
