由于猪场卫生条件差，湿热毒邪污染饲料、饮水、用具等，加之冬春季节天气寒冷猪舍湿度高，饲养密度大，使猪体卫外能力下降，湿热毒邪经口鼻而入导致本病发生。湿热疫毒内侵，湿热相搏，里结胃肠，故出现呕吐；脾阳不振，水湿运化失司，如命门火衰，不能蒸化水湿，水湿下注而成泄痢。
猪传染性胃肠炎的发病原因：1.在连续生产的猪场，不断容易感染的猪引进，导致病毒难以根除，持续存在，一到合适的寒冷季节，就容易爆发育肥猪传染性胃肠炎。2.病猪、带毒猪、带毒的猫、狗、鸟类等都是传染性胃肠炎的主要传染源，可通过鼻液、粪便等将病毒排出体外，传染给健康猪。3.新引进的育肥猪和失去母源保护的断奶仔猪容易感染猪传染性胃肠炎。
