为了提高果实品质，减少缺素发生，应提倡使用有机肥，农家肥。以往提出的斤果斤肥仍然适用。牛羊粪、鸡粪都是较好的有机肥源。作为常用的基肥，施肥时期通常在秋季。从9月中下旬到10月上旬施肥，对根系生长及树体营养贮存最为有利。施肥的方法因树龄而异。幼树时期，通常结合果园改土扩穴施肥，每年在定植坑以外捥坑施肥，坑深40-50厘米，将有机肥与果园表土1：2混合均匀后填入坑内，依次向外扩展。成龄果园可全园耕翻施肥或开沟施肥。
苹果树施肥主要有根施和叶面水肥。
