常发根腐病，炭疽病，蔓枯病，叶枯病，叶螨，蚜虫等，还有枯萎病，病毒病等毁灭性病害，以及疯秧，空心，裂蔓，黄筋等生理性病害。
（1）育苗期。此期病害主要有立枯病以及早期蔓枯病等。（2）移栽定植期。此期主要病害有蔓枯病、炭疽病；虫害为地下害虫等。（3）定植到开花期。此期主要预防蔓枯病、炭疽病、灰霉病等病害以及蚜虫等。（4）开花坐果期。这个时期蔓枯病、炭疽病、灰霉病、霜霉病等开始大量发生，虫害有蚜虫、蓟马以及夜蛾类害虫。（5）坐果后。西瓜坐果后各种病虫害都开始发生，主要包括蔓枯病、炭疽病、白粉病、灰霉病、霜霉病以及蚜虫、蓟马、红蜘蛛、甜菜夜蛾等。
西瓜整个生育期病害主要有：立枯病，蔓枯病，炭疽病，灰霉病，霜霉病，白粉病等。虫害有：蚜虫，蓟马红蜘蛛等。
