魔芋软腐病的感染途径主要有：种芋带病、土壤传播、病菌从伤口浸染，防治软腐病要从多途径、多措施进行防治。
1、轮作，选好前茬作物：尽量选择小麦、大麦、玉米等植物作为前茬，避免与十字花科蔬菜、茄科蔬菜及瓜类连作。
2、选好地块并及早翻地整地：魔芋适宜在土质疏松、土壤肥沃、通气性好的沙壤土中生长，喜湿怕涝，因此应选地势高、排水方便的地块。并及早腾地、翻地，促进病残体腐烂分解，在整地时每亩可使用20公斤以上生石灰，进行土壤消毒，降低田间病菌数量。
3、平整土地，修好排灌系统：尽量采用深沟高畦栽培，一方面可以防止雨后渍水造成魔芋根系伤口，另一方面可以促进魔芋根系生长，增强抗病性。
4、安全运输、储存种芋：种芋采挖后要轻拿轻放，用筐、纸箱等装运，并在筐、纸箱内垫松毛等疏松干燥物，储存前将种芋晒2-3天，待伤口痊愈。播种前再晒1-2天，可起杀菌、催芽、促进芽齐芽壮的
5、合理进行间作套种：要选择高秆作物与魔芋套种如玉米等，可以起到遮阴的作用，防止太阳光直射灼伤魔芋叶片，易于软腐病菌侵入。在与玉米进行间作套种时，要实行单行定向套种，主要依据行向确定玉米栽植的方向。不能与低秆作物套种，如大豆等，不仅不能起遮阴作用，还会因影响魔芋田间的通风而增加田间的相对湿度，促进魔芋软腐病的发生。
6、合理施肥：施用的农家肥要充分腐熟，否则会使肥中带菌，还会引起烧根。提倡将农家肥进行撒施,亩施用高钾类复合肥20-30公斤，先摆放种芋，再覆土3-5cm，后将复合肥撒施在上面，再理沟提厢，做到厢面平整厚实。在换头期、块茎膨大期各追一次肥，每次追肥10-15公斤高钾复合肥，不要追单纯的氮肥（尿素）。在生长期可结合施药喷施高钾类叶面肥，如：磷酸二氢钾、高钾素。
7、及时防治害虫，减少伤口：要及时防治蛴螬、蝼蛄等地下害虫，这些害虫不仅可以造成魔芋根部及块茎伤口，而且还会传播软腐细菌。
8、及时消除发病中心，防止扩展蔓延：发病初期及时拔除病株，井带出田间销毁，同时在病穴及其周围撤一些生石灰，并用农用链霉素、甲霜恶霉灵、氯溴异氰尿酸、王铜、可杀得等喷淋处理。
