病菌附着在种子或病残体上越冬，种子带菌是翌年主要初侵染源，该菌在埋入土中西瓜皮上可存活8个月，在病残体上存活2年，在田间借风、雨及灌溉水传播，从伤口或气孔侵入，果实发病后在病部大量繁殖，通过雨水或灌溉水向四周扩展进行多次重复侵染。多雨、高湿、大水漫灌易发病，气温24~28℃经1小时，病菌就能侵入潮湿的叶片，潜育期3~7天，细菌经瓜皮进入果肉后致种子带菌，侵染种皮外部位，也可通过气孔进入种皮内。
