一、工艺更简便固体菌种的生产工艺为一级试管种→二级原种→三级栽培种，而液体菌种则没有级的分别，也就是说液体菌种既可以做为母种接原种，也可以做为原种或栽培种直接接栽培袋，简化了生产工艺。
二、菌种更纯生产固体菌种频繁扩接转代，生产中烟薰火烧，使菌丝活力大大降低，极易造成污染。而液体菌种生产需经过筛选、提纯，属纯菌种；在生产过程中设备封闭运行，属纯培养。这样高纯度的菌种，固体菌种怎能与之相比呢？
三、周期更短采用固体菌种，从制种到出菇一个周期下来至少需要4－5个月，甚至半年多。而采用液体菌种从制种到菌丝长满栽培袋只需30天左右的时间，从制种到出菇大部分品种只需1个月，整个生产周期一般也就是两个月。
四、成本更低以前采用固体菌种的栽培户都知道，无论使用二级种还是三级栽培种生产栽培袋，菌种所占的成本都在1角钱以上，而用液体菌种无论是生产栽培种还是栽培袋，其菌种成本就2－3分钱，您说哪个更划算？
五、污染更少采用固体菌种进行食用菌生产，栽培袋的污染率大都在8－10％。而采用液体菌种接种后6小时萌发，24小时菌丝布满培养料面，菌种萌发速度超过杂菌生长速度，没有杂菌污染。
六、操作更简便nbsp;nbsp;固体菌种生产需重复备料、拌料、装瓶（袋）、灭菌、接种、养菌，而液体菌种整个生产过程都是在一个罐体内完成，按键操作，既成倍降低了生产、管理费用，又节省人工，轻松制种。
七、出菇整齐上市早采用液体菌种的产品可以比采用固体菌种的早上市2个月以上，早上市与晚上市在效益上差的可就大了。此外，采用液体菌种的栽培袋菌龄短，出菇整齐一致，适合出口要求，在价格上占优势。
八、适宜工厂化标准化生产采用固体菌种袋内菌丝菌龄不一致，加之受自然条件的制约，需多潮出菇多茬管理，有的没出完菇还要越夏或越冬管理。而采用液体菌种养菌时间短，出菇集中，适合工厂化、标准化全年候生产，代表产业发展方向。
