香菜菌核病主要为害茎基部，其次是叶片。开始时，出现褪色水渍状病斑，后来变成淡褐色，迅速扩大，绕茎一圈，随后向上向下发展。
侵染茎基部或茎分杈处，病斑扩展环绕一圈后向上向下发展，潮湿时，病部表面长有白色菌丝，随后皮层腐烂，内有黑色菌核。
