选用抗病品种。建立无病留种田，选用无病种子。合理密植，适时移栽。施足基肥，增施农家肥，少施氮肥，配施磷、钾肥，增施硅肥，慎用穗肥。适时晒田，齐穗后干湿交替。及时摘除病粒带出田外深埋或烧毁。发病稻田水稻收割后要深翻、晒田。
避免病田留种，深耕翻埋菌核。发病时摘除并销毁病粒。
合理密植，有利通风，种植抗病品种。
选用抗病品种，适时晒田，慎用穗肥。
水稻稻曲病的农业防治：1、选育抗病品种；2、种子消毒；3、加强栽培管理，合理密植，培育健壮植株，增强抗病能力，后期降低田间湿度。
选用较抗病品种，适当稀植，抛秧栽培一定要注意稀抛，培育强壮的有效穗;合理施肥，控制氮肥用量，增施磷、钾肥，早施追肥促早发，控制穗肥用量，改传统的施肥方法为平衡促进法，使稻株后期自然落黄，增强稻体抗病能力;合理灌水，适时适度搁田、晒田。
选择抗病品种做好种子消毒，加强田间栽培管理，适时药剂预防。
选用抗病品种，合理密植，科学浇水施肥。
稻曲病：（真菌性病害）1，关键在早期预防，于水稻破口前5一7天，可选用：43%好力克，30%爱苗，18%多菌酮粉剂，30%琥胶肥酸铜，20%噻菌铜，50%绿享6号，12.5%井.蜡芽。75%肟菌.戊唑醇，300克/升苯甲.丙环唑，己唑醇，噻呋酰胺，腈苯唑，氟环唑。等，（喷雾防治）。2已发病严重时可用：咪鲜胺，氢氧化铜，碱式硫酸铜等（喷雾，能把灰苞打掉。）。
水稻破口前三天左右用井冈霉素。
