轮作换茬。实行轮作换茬，对于解除连作障碍最有效、最经济。例如瓜菜与大田禾本科、豆科作物轮作。
合理嫁接。瓜类用黄瓜、甜瓜与南瓜嫁接，利用南瓜高抗枯萎病、高抗土传病害的特性以及南瓜根系耐低温、吸收能力强的特性克服棚室连作障碍，不影响棚室的经济效益，生产中大多采用。
及时换上。种植前需要将棚室内的表土取出运出棚外，然后回填外部新土。
土壤消毒。温度过高密封可起到棚内土壤消毒杀菌作用，同时可喷施护树大将军消毒杀菌，抑制病菌感染，增加作物经济效益。
