水稻条纹叶枯病在水稻苗期发病心叶基部出现褪绿黄白斑，后扩展成与叶脉平行的黄色条纹，条纹间仍保持绿色。分蘖期发病先在心叶下一叶基部出现褪绿黄斑，后扩展形成不规则黄白色条斑。拔节后发病在剑叶下部出现黄绿色条纹，各类型稻均不枯心。老叶不显病，但病株常枯孕穗或穗小，畸形不实。而水稻纹枯病菌为害叶片和叶鞘。最初在基部叶鞘上发病,之后向上扩展，病斑有椭圆形,水渍状,后变灰褐色,病斑常相互合并成不规则的云纹状。病情发生数日后,肉眼可见表面有菌丝长出,纠结成团,后变成褐色的菌枚。可采用井冈霉素防治水稻纹枯病。
水稻条纹叶枯病是灰飞虱传毒的病毒病，上部叶片有黃绿相间的条纹，发病重时心叶黄枯死亡。纹枯病是茎基部有云纹病斑，是真菌病害。
