谷子的主要病害有谷子白发病、谷子锈病、谷瘟病、谷子叶斑病及谷子褐条病等。
主要为害叶片。叶斑椭圆形,大小2-3厘米,中部灰褐色,边缘褐色至红褐色。后期病斑上生出小黑粒点,即病菌分生孢子器。病菌主要以分生孢子器在植物病残体上越冬。翌春产生分生孢子,借风雨传播蔓延,进行初侵染和再侵染。多雨年份,多雨季节,缺肥易发病。