抓紧用粉锈宁等杀菌剂喷雾防治。
（1）选用抗病品种，如东北麦区的克丰系列、克旱系列、新曙光系列、龙麦、辽麦系列，内蒙古的蒙杂系列，黄淮地区的泰山1号等。大多抗21号小种，要注意新小种34C#3和34C#3。种植时要兼顾抗源的多样化和合理布局。新育出的抗秆锈的春小麦品种有蒙麦30号、龙麦23号、龙辐麦7号、陇春15号、宁春24号、陇春8139、定丰3号等。抗秆锈冬麦品种有京411，皖麦26、27，豫麦18号，新宝丰（7228），早麦5号，贵丰1号，滇麦18、19号。（2）药剂防治参见小麦条锈病、叶锈病。
在分蘖到拔节期追施草木灰、钾肥，在拔节到抽穗期喷施磷肥，增加植株抗病能力。
锈病选择三唑类、烯唑类为主的高效低毒内吸杀菌剂防治。每亩用戊唑醇或吡唑醚菌酯或或多酮三唑酮或三唑醇或烯唑醇或己唑醇喷雾防治，可同时防治小麦白粉病、赤霉病，视发病情况，隔7-10天再喷一次。
秆锈病防治起来，要比条锈病，叶锈病难一些，可以用粉锈宁，或者戊唑醇，用无人机防治效果最好。
一.以抗锈病品种为主栽培和药剂防治为辅。二.适期播种，避免早播。
小麦杆锈防治，选用抗病品种，药剂拌种，合理密植，发病初期用已唑醇等农药喷施防治等。
小麦得了秆锈病防治选用优良品种，药挤拌种，避免早播。用已三唑醇等农药喷雾。
