皮下组织可见水肿而黄染，骨骼软弱且多汁，呈柠檬黄色，可见其胸、腹腔内有黄色液体存在。肝脏增大，呈黄褐色，质脆弱或柔软。肾脏的病变有诊断意义，肾脏快速增大，被膜极易剥离，切面常湿润，髓质与皮质的界限消失，组织柔软而脆弱。病程长久，则肾脏呈坚硬状，可见肺脏黄染，有时水肿，而心脏淡红，大多情况带淡黄色，膀胱黏膜出血，脑室中积聚大量液体。血液稀薄如水，红细胞溶解，在空气中长时间放置不会凝固。
解剖发现皮下组织水肿而黄染，骨骼软弱而多汁，呈柠檬黄色，胸，腹腔内有黄色液体，肺脏出血、黄染、肝脏增大，呈黄褐色。肾脏肿大而有出血点。
尸体消瘦，皮肤有干裂性坏死病灶，口腔黏膜有溃疡，黏膜有不同程度黄染，皮下胶样浸润及出血，肠黏膜与浆膜有大量出血，胸、腹腔有大量黄色渗出液，肺、心、肾、脾等实质器官有出血点，肝肿大、松软，呈黄色或色调不均匀，质地脆弱，肾肿大，皮质有散在的灰白色病灶，肠系膜淋巴结出血、肿大。
黏膜有不同程度的黄染，皮下胶样浸润及出血，肠黏膜及浆膜有大量出血，胸腹腔有黄色渗出液；肝通常肿大松软，呈黄色或色调不均匀，质地脆弱；肾脏增大数倍，皮质有散在的灰白色病灶，淋巴结肿大、出血。
皮下组织水肿而黄染，骨骼软弱而多汁，呈柠檬黄色，胸，腹腔内有黄色液体，肺脏出血、黄染、肝脏增大，呈黄褐色。肾脏肿大而有出血点。
死亡病例尸体消瘦，皮肤有干裂性坏死性病灶，口腔黏膜有溃疡，且有不同程度的黄染，皮下胶样浸润及出血，肠黏膜及浆膜有大量出血，胸、腹腔有黄色渗出液。肺脏、心脏、肾脏和脾脏等实质器官有出血斑点。肝脏肿大、松软，呈黄色或色调不均匀，质地脆弱；肾脏肿大，皮质有散在的灰白色病灶。肠系膜淋巴结肿大、出血。
力较强的黄疸出血型、秋季型、澳洲型、犬型等钩体菌型的感染，常引起黄疸、出血和肾功能衰竭；而伤寒流感型、7日热型，特别是波摩那型等毒力较弱的感染，则常引起钩体病的轻型。然而，病情的轻重可能与人体免疫状态的高低有关。
病变可见黏膜及皮下组织黄染，口腔黏膜有溃疡，皮肤有干裂坏死病灶。肝脏肿大、松软、呈黄色，质地脆弱;肾肿大，皮质有散在的灰色病灶。肺、心、肾和脾等实质器官有出血斑点。胸腹腔内常有黄色液体潴留，还可见到膀胱积有深黄色或红色尿液。淋巴结肿大，特别是肠系膜淋巴结肿大、出血。
