发病原因主要通过湿度和降雨，侵染花柱头，病菌潜藏于果核，成熟时，至库存贮藏期发病，由里往外腐烂，形成烂果。
主要通过气流传播，在苹果开花期通过柱头侵入。病菌自花瓣张开后首先定殖于花柱，随后在萼心间组织蔓延而侵入果实心室。此后，在整个果实发育期，病菌陆续进入心室，直至果实采收。
苹果霉心病发病原因是开花时雨水多的。
