用福美双、戊唑醇、咯菌腈、种菌唑等药剂包衣预防。
将病株尤其是病穗，小心翼翼包好带出田间集中焚烧，不然土壤菌源量大，明年会更多。播种时专门拌种，包衣剂不是完全可靠。
玉米黑穗病用种菌唑药剂包衣预防效果好。
