首先通风排湿，降低棚内湿度，其次喷药防治。
药剂防治。适时适量使用高效低毒、低残留农药，抓住关键时期防治，尽量减少农药使用量及次数。在苗期用65%福美锌500倍液，或1：1：150倍波尔多液喷雾；结果期用75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或甲基托布津600倍、代森锰锌500倍两剂合用，或1：1：100倍波尔多液，连续防治2-3次。在定植前，用50%多菌灵可湿性粉2千克处理土壤，移栽时用木霉菌150倍液蘸根后移栽，成活后用30%dt悬浮剂350倍液灌根；发病初期，用50%多茵灵或托布津500倍液灌根。
防治大棚蔬菜椒类灰霉病，应注意清理及时掉有病的枝叶、花和果等，再用咯菌腈、凯泽、速克灵、异菌脲等杀菌剂全面处理土壤、花器、幼果以及整个大棚，就可以大大减少灰霉病菌的数量。
