蒲桃常见有煤烟病、炭疽病、果腐病、金龟子、介壳虫、毒蛾、蚜虫、果实蝇、避债蛾、蓟马、瘿蚊，但因蒲桃结果期长及果皮薄，所以不适合使用农药，特别是剧毒、吸收或长效农药。
一、煤烟病
症状
黑煤烟病菌在蒲桃叶表面形成一层黑色覆盖物，影响叶片的光合作用。发生严重时，蒲桃生长受抑制，花芽或新芽抽出困难。病菌在叶表形成黑色薄膜，但阻碍叶片进行光合作用。
发病规律
管理不良的果园常发生煤烟病，尤其是害虫防治不力时更易发生。蒲桃害虫如叶蝉、介壳虫类及粉虱皆可在蒲桃叶片或枝条上分泌蜜露，诱发煤烟病。煤烟病的发生受虫类危害所致，危害昆虫密度大时，煤烟病的发生也随之严重。
防治方法
主要以防治害虫为主，控制害虫消长，即可控制本病害的发生。田间果树一旦受煤烟病为害，可将受害叶片和枝剪除，减少感染源。另外，在煤烟病发病严重的果园要减少或尽量不用含有碳水化合物的营养剂进行叶面喷洒（如糖类等）。
二、炭疽病
症状
炭疽病在果实上初期病症为褪色状小斑点，稍向内凹陷，病斑扩展速度很慢，分生孢子多时，呈现粉红色或橙色，有时形成轮纹状排列。此一病斑如果与其他果实因互相靠近而形成通风不良或湿度高的环境时，病斑的发展便会快速扩大，使分生孢子有利于造成新的感染。叶片受炭疽病感染也形成斑点，造成坏死现象，其上偶有白色粉块，是炭疽病分生孢子堆，病斑黄褐或灰白色，形状不规则。
防治方法
加强肥水管理，提高树体的抗病力，及时修剪病枝、徒长枝，使果树通风良好，搞好果园清洁，可防止和减少病害发生。
药剂防治可选用56%特克多可湿性粉剂、50%多菌灵可湿性粉剂、50%退菌特、50%托布津或75%百菌清。
在蒲桃幼果（吊钟期）喷药后进行果套袋。
三、果腐病
症状
果腐病原菌侵害蒲桃的叶片及果实。果实受害较严重，果实发病初期形成水渍状、褪色斑或淡紫色斑。病斑扩大呈圆形，表面散生分生孢子堆，呈黑色小点状突起，果肉色泽变淡，出现黄褐色或淡紫色斑点，最后变成深紫色或黑色。病果常悬挂在枝条上，并不立刻坠地，后期果实脱水皱缩干枯，呈干枯状而坠落地面。受害叶片上形成不规则褐色病斑，后期有黑色小点散生于病斑表面。
防治方法
化学药剂防治可用的药剂包括代森锌、乙磷铝、瑞毒霉等。
物理防治利用套袋阻隔病菌侵入。
对园内寄主同时喷药，减少病原和病害发生。
清洁果园，避免扩散感染。
四、藻斑病
症状
在叶片上可形成两种不同形态的病斑：一种表面生有纤细绒毛，为病菌孢子囊柄及顶生孢囊，病斑周围透明，似油状光泽。受害的蒲桃叶片提早落叶，影响光合作用，进而影响蒲桃品质。
防治方法
可利用栽培管理及化学方法降低病原。如强热修剪，药剂或肥料强迫落叶，使病原减少到最低量。在生长过程中适当修剪，使枝条通风良好，可有效降低藻斑病。有机铜剂或波尔多液对藻斑病菌有相当好的抑制效果。
五、东方果实蝇
症状
雌虫产卵于果实表面，幼虫蛀食果实，使附近的果肉腐烂，并促使落果。老熟幼虫由果肉内钻出，入地化蛹。成虫最多可产卵1000粒。高温期一代短于1个月，繁殖快速。
防治方法
结果期可悬挂含毒甲基丁香油、诱虫灯或纤维板诱杀雄虫，本法只诱杀雄虫，对雌虫无效，需附近果实同时悬挂，否则效果不很好。
化学防治。可撒布25%马拉松可湿性粉剂，或5%倍硫磷乳剂200倍液混合蛋白水解物（或3%红糖水），每7天喷撒1次，喷洒小树并喷及树冠，果园附近的草丛或树丛叶片上均要喷撒，以毒杀成虫。
清洁果园，捡拾病烂果实深埋土中或淹水。
套袋。可用套袋处理，既可防止果蝇为害，又可防鸟害及寒害。
