按照“预防为主，综合治理”的总方针，以农业防治为基础，根据病虫发生、发展规律，因时、因地制宜合理运用化学防治、生物防治、物理机械防治等措施，经济、安全、有效、简便地控制病虫害。
农业防治合理布局，避免与脐橙有相同病虫害的果树混栽。加强栽培管理，健壮树势。促进园地群体和个体通风透光，创造有利于生长发育的环境条件，使之不利于病虫的发生。合理修剪、及时清除病虫危害的枯枝、落叶、落果、减少病虫源。生物防治保护和利用天敌，用有益生物消灭有害生物，维持生态平衡。
在化学防治上，应当减少化学农药的使用，控制环境污染，提倡人工治虫，可以用人工防治的不用药剂防治，可以点治或挑治的不全面喷药。防治时，应选用高效、低毒、低残留和对天敌杀伤力低的药剂，对症下药，合理使用。注重喷药质量，减少用药次数，交替使用不同的药剂，延缓病虫抗药性。
当前，要注意防治溃疡病为主，兼治锈壁虱和潜叶蛾、脐黄病。若遇多雨低温，还须加强红黄蜘蛛的防治。
