果穗染病端部变为紫红色，有时籽粒间生有粉红色至灰白色菌丝，病粒失去光泽，不饱满，发芽率降低，播后易烂种。轻的幼苗生长发育不正常，叶片变黄。有时现茎腐病症状，茎秆局部褐色，髓部变成紫红色，易倒折。叶鞘染病生有橙色点状粘分生孢子团。
禾谷镰孢菌侵染引起的赤霉穗腐病，在玉米灌浆期开始发生，乳熟至蜡熟期表现症状。多从果穗顶端向下蔓延，遍及大半个果穗，早期被害果穗可能全部烂掉，危害轻时果穗表面色泽仍然正常，但脱粒后可见穗轴与籽粒基部呈紫红色。受害严重时整个发病部位变成紫红色，籽粒间隙布满粉红色或灰白色菌丝体。病粒无光泽，不饱满，重者变红褐色，质脆，内部空虚，常被交织的菌丝体充满。
