在土壤中和病残体中越冬的菌核，是主要初次侵染来源。气候适宜，土壤表层的菌核陆续萌发产生子囊盘，子囊成熟后可弹射出大量子囊孢子，进行初侵染。子囊孢子在田间可存活12天。本菌不产生无性孢子，但可以菌丝体接触，进行再侵染，所以倒伏可使大豆病株上的菌丝接触健株而加重病情。
该病与阴雨天地势低洼积水，重茬，施有氮肥过多等因素有关。
大豆菌核病的病源是:子襄菌亚门核盘属真菌核盘菌侵染发生发病长过程。该病菌随作物的残体在土壤中越冬或种孑上带菌而再次相适宜的温湿度下萌发侵染，每个菌核可萌发1一7个子襄盘，成熟的子襄盘淡黄色盘状、上生栅状排列的棒状子襄，内含8个椭圆形的无色单胞子襄袍子。无仑丝状的侧丝夹生存在子襄中间。
