水稻稻瘟病主要是秧苗韦缩，秧苗有黑板点等。
从苗期至整个生育期都有危害，叶瘟发生于三叶前，病苗基本灰黑。分蘖至拔节期危害较重，病斑中央灰白色，边缘褐色，外有淡黄色晕圈。
主要以叶瘟和穗颈瘟为害为主。叶瘟从底部叶片开始发病，病斑梭形黄褐色边缘，中间有灰白或白色斑点，病斑背面有灰色每层。穗颈瘟在穗茎处产生褐色小点，逐渐扩大病斑附近一段茎杆呈黑褐色或蓝黑色，最后整个穗变成白色。
