发生于三叶前，由种子带菌所致。病苗基部灰黑，上部变褐，卷缩而死，湿度较大时病部产生大量灰黑色霉层。
该病的症状和特点与本田稻瘟病相同，有所区别的是苗期稻瘟病基本都是急性病斑，病苗移栽到本田后急速发展。苗期稻瘟病是在育苗期间棚内温度高，通风少的、湿度大，很适合稻瘟病的发育。
