大豆田排水良好、地势平整发病轻；合理密植、通风透光条件好的地块发病轻。地势低洼及排水不畅、施用氮肥过多、大豆生长茂密和通风不良，有利于大豆菌核病的发生。
在病源菌充足的条件下，田间湿度成为影响发病的主要因素，高湿利于菌核病的发生，干旱少雨则发病轻。此外地势低洼、长期积水发病重，岗地、排水通畅地块发病轻。大豆种植过密也利于菌核病发生。
