防止生姜枯萎病提倡水旱轮作。
选地势高燥、排水良好地块种植，并注意田间卫生，及时收集病残株烧埋；重病地块宜实行轮作。提倡施用酵素菌沤制的堆肥和充分腐熟的有机肥，适当增施磷、钾肥，播种前精选姜种，并用50%多菌灵可湿性粉剂300～500倍液浸姜种块1～2小时，捞起拌草木灰下种。发病初期于病株及其四周浇灌50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或10%双效灵水剂200～300倍液，或70%琥·乙膦铝可湿性粉剂300～400倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，隔3～5天1次，连续防治2～3次，以控制病害蔓延。
发病初期于病穴及其四周植穴淋施50％甲基硫菌灵硫磺悬浮剂800倍液或10％混合氨基酸铜水剂400倍液、70％琥乙磷铝可湿性粉剂300一400倍液。防治1一2次，以控制病害蔓延。
