辣椒炭疽病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先选择优良品种，消毒育种，合理轮作，加强栽培管理；再结合化学药剂进行防治。
在辣椒定植时，再用4.8%苯醚·咯菌腈悬浮种衣剂1000～1500倍液灌根，然后封土，可有效保护定植后的幼苗不被病菌危害，持效期可达50～80天，基本上可保证盛果前不会发生炭疽病。
辣椒炭疽病用溴菌腈复配苯醚甲环唑防治。
辣椒炭疽病可以用杀菌剂防治。
